Der erstellte Paraffin-Block wird durch Kühlung auf -20°C gehärtet. Dies erlaubt das Erstellen von hauchdünnen Schnittpräparaten mit einer variablen Schnittdicke zwischen ca. 2 µm bis 6 µm. Für die exakte Anfertigung dieser histologischen Schnittpräparate verwenden wir ein Präzisionsmikrotom.
Für die histologische Begutachtung werden die Schnittpräparate auf spezialisierte Objektträger aufgezogen und auf einer "Streckbank" erwärmt. Anschließend wird das Gewebe erneut mit Xylol fixiert, mit einer absteigenden Alkoholreihe entparaffiniert und im letzten Verarbeitungsschritt mit spezialisierten Färbeprotokollen für die histologische Begutachtung gefärbt.